因應國際上生物技術產業快速發展和相關產業的升級，以提昇國際競爭力，政府持續支持與發展國內生物技術相關產業，學校亦迫切需要培育相關優秀人才。虎尾科技大學鄰近於中部科學園區的虎尾基地，此基地亦是生物科技產業發展/農業生化科技的重要園區。基於國家和區域產業發展，本校生物科技系（以下簡稱本系）於92年奉准設立四技部，並於97年設立碩士班及98年設立碩士班在職專班。97-100年招收產學攜手專班。98年成立農業與生物科技產品檢驗服務中心 (簡稱: 農檢中心，目前屬於校級單位)。110年設立智慧生物科技技優領航專班(簡稱:智慧生技專班)。目前系上共有15位專任老師，均具有博士學位。其中8位教授、 5位副教授、 2位助理教授。目前本系的師資領域涵蓋農業生技以及其衍生加值的食品、環境、醫藥健康生技。

           本系目標方向以朝向建立具備「生物科技產業鏈之相關實務技術」為主軸的生物技術專精人才培育來規劃。結合具產業經驗之生物科技專業師資，發展生物科技之實務教學及產業應用性之研究，如:生物檢測技術、開發生物製劑、天然藥物及保健食品開發、食品加工技術開發、生物材料開發及生質能源之開發、藥物殘留檢測技術、生物病源檢測等。面對大數據分析、自動化和智慧化導入至包括新農業、食品業、 醫藥與健康產業等生技相關產業，本系新設立智慧生技專班，系所朝向智慧化和精準化發展，結合跨不同學院科系(包括:本校工程、電資及管理學院的相關科系)之現有研究及教學資源，將能培育整合性甚至跨領域之生物科技產業人才。

           農業是國家之本，雲林號稱農業首都口號，在落實至產業與人才培育，皆須仰賴在地大學之教育資源與研發能力，本系投入之農業與生物科技檢驗服務中心，為食安檢驗中蔬果之農藥安全把關。將進一步建置普及化智能化快篩系統，以及其他食品分析與安全檢測。在其他生技領域，本系亦朝向精準化和跨領域化發展。系上教授無論在產學合作或研發方面，均有亮眼的表現。

           我們向來強調有效運用雲林縣豐富的農業資源與附近相關產業之具有實力，以發展出特有之生物科技產業鏈所需之技術。近年來系上在生物科技於食品和農業的應用投入不少心血，積極於善盡社會責任和地方創生，並研發農業廢棄物再利用以增加農產價值、改善環境和增進資源循環。此外，雲林縣政府的農民大學在過去多年來由本系協助。目前的雲林縣智慧農業大學亦由本系主要負責協助教育與訓練。本系致力於培育學士、碩士、碩士在職專班之人才，甚至未來亦可協助雲林發展成為農業生物科技大縣。本校其它科系或鄰近學校之研發能量互補長短，將是本系可發展之獨特性與競爭優勢。

(2022.08 update)